优化辐射避难所布局的核心在于合理分配空间、优先级排序以及灾难应对效率。生产区应置于上层，包括电力、水和食物房间，确保资源快速收集和入侵防御。训练区位于中层，便于属性提升与人员调配。住宅区和仓库区建议放在下层，减少火灾风险且避免占用核心空间。特殊功能房间如医院和武器工厂需独立规划，确保不影响日常运转。电梯每层仅需一个，过多会浪费电力且增加管理难度。
相同类型的三联房间能大幅提高产量并降低升级成本，例如三联电站比三个独立电站更节省空间和电力。生产类房间优先升级，尤其是电力设施，其稳定性直接影响其他房间运作。训练房间初期可保持低级状态，后期根据居民属性需求逐步调整。灾难应对时，三联房间更易集中处理火灾或虫害，避免蔓延至其他区域。
入口处部署高属性居民和强力武器，第一时间拦截入侵者。生产区周围安排备用人员，确保灾难发生时能快速支援。仓库区可分散布局，避免集中存放引发连锁灾难。巧手先生机器人可用于自动收集资源，但需注意其无法独立处理灾害，仍需人工干预。
娱乐设施如健身房和电影院可提升居民幸福感，间接提高工作效率。动态调整居民岗位，确保高属性人员集中在关键生产区。后期瓶盖充足时可重构布局，拆除冗余建筑如低级宿舍或广播站。避免盲目扩张人口，优先培养高质量居民再逐步增加规模。
避难所布局没有绝对标准，但遵循空间利用、优先级和防御协同的原则能显著提升生存效率。初期以基础资源稳定为目标，中期强化训练与装备，后期转向属性优化与任务完成。定期检查电力与食物供需平衡，及时调整房间等级与人员配置，才能实现避难所的长久运转。
